第三方支付发展的影响因素主要有以下几点：
安全性
    相对于传统的资金划拨交易方式，第三方支付比较有效地保障了货物质重、交易诚信、退换要求等环节，在整个交易过程中，都可以对交易双方进行制约和监督，不需要面对面进行交易的电子商务形式中，第三方支付为保证交易成功，提供了必要的支持，因此随着电子商务在中国国内的快速发展，第三方支付行业也发展得比较快。
行业环境
    无数行业发展史表明，初期国家了支持某行业的发展，总是给其提供宽松的环境，但发展到一定程度特别是高速发展的时期，国家有关部门就会加强管理，有必要的、有效的规范、监督与管理，以保证行业继续健康发展。央行曾经提出某些市场创新产品，如网上支付、移动支付等电子支付方式，在缺乏规范约束的情况下发展可能面临一定的风险，需要相应的法规制度进行规范管理，而网上支付、移动支付是第三方支付主要的运营形，明显这些想法就是向第三方支付行业传递一个明显的信号：要对第三方付行业进行治理了。
行业治理
    第三方支付行业确实该治理，无序竞争使各家的利润不高甚至亏损经营，没有造血功能的行业，生命力就不强。目前大多第三方支付平台还是靠收取支付手续费，即第三方支付平台与银行确定一个基本的手续费率，缴给银行；然后，第三方支付平台在这个费率上加上自己的毛利润，向客户收取费用。但是由于竞争的残酷，为抢占更多的客户，有些第三方支付公司甚至不惜血本多将向客户的提成份额一降再降，优惠条件层出不穷，不少第三方支付企业在很长时间一直在赔本赚吆喝。
网上银行
    除了第三方支付企业之间的残酷竞争外，原来第三方支付所依赖的银行也逐渐从幕布后走向前台，大有取代第三方支付企业之势。当初，第三方支付企业出现时，银行认为第三方支付有利于为自己发展新业务，且不管这些支付企业怎么折腾，也都不会威胁到银行自身在这个行业中的主导地位，也正是基于这种认识使得银行对于当初第三方支付平台的发展能够持一种比较开明宽容的态度。而最近银行好像对于网上支付的这块肥肉也产生了兴趣，目前，中国工商银行、招商银行，兴业银行、广发银行等都已经在网上电子支付投入了很大力量，除此之外，央行批准的15家外资银行准许在中国开办网上银行，这无疑会在中国银行业开放之后对中国国内第三方支付企业造成一定的冲击。
    最后必须要提及的是第三方支付企业背后往往有外资、内资或知名电子商务网站等资金较为雄厚的投资者支撑，在当前为了占领地盘微利经营甚至亏本经营的时期，投资者的支持与否甚至能决定第三方支付企业能否生存下去，但当前大环境的投资趋冷将使第三方支付企业的生存环境更加恶劣。